En identifiant l'espèce de baleine, notez la forme du jet, la forme et la position de la nageoire dorsale (ou le manque de la nageoire dorsale), et si elle soulève sa queue en plongeant. La taille, la couleur, et la forme des nageoires peuvent également aider l'identification. Référez-vous à la forme de la tête, à la taille et aux couleurs principales en identifiant les phoques. Les phoques gris et les phoques communs se reposent sur des roches et se retrouvent souvent ensembles. 

Si vous décidez de participer à une excursion d’observation de baleines, respectez le code d’éthique et les règles du Ministère des pêches et océans Canada.  Évitez d’approcher de trop près les baleines (< 100 m).

Les cétacés

Mysticètes ou les baleines à fanons :
Baleine franche ou baleine noire (Eubalaena glacialis) - commun
Rorqual bleu (Balaenoptera musculus) - rare
Rorqual commun (Balaenoptera physalus) - commun
Rorqual boréal (Balaenoptera borealis) - occasionnel
Petit rorqual (Balaenoptera acutorostrata) - commun
Baleine à bosse (Megaptera novaeangliae) - occasionnel à commun

Baleine grise de l'Atlantique (Eschrichtius robustus) - éteint

Odontocètes ou les baleines à dents :
Cachalot pygmée (Kogia breviceps) - 2 baleines échoués
Cachalot (Physeter macrocephalus) - occasionnel 
Baleine à bec commune (Hyperoodon ampullatus) - 1 baleine échoué
Baleine à bec (Mesoplodon sp.) - possible 
Béluga (Delphinaptera leucas) - occasionnel 
Épaulard (Orcinus Orca) - rare, autrefois commun
Globicéphale à nageoires longues (Globicephala melaena) - occasionnel 
Dauphin à nez blanc (Lagenorhynchus albirostris) - rare, autrefois commun
Dauphin à flancs blancs de l'Atantique (Lagenorhynchus acutus) - occasionnel à commun
Dauphin à gros nez (Tursiops truncatus) - 1 dauphin échoué
Dauphin commun (Delphinus delphis) - dauphins échoués? 
Marsouin commun (Phocoena phocoena) - commun 

Phoque commun (Phoca vitulina vitulina) - commun
Phoque gris(Halichoerus grypus) - commun 
Phoque à capuchon (Phoca groenlandica) - rare
Phoque du Gorenland (Crystophora cristata) - rare 

Morse (Odobenus rosmarus) - éteint à la baie de Fundy depuis 100-150 ans

Rorqual commun (Balaenoptera physalus)
Longueur : 15-24 m
Caractéristiques : 
Jet grand et droit
Longue tête étroite et aplatie, couleur asymétrique (mâchoire droite blanche et mâchoire gauche foncée)
La nageoire dorsale vers l’arrière et courbée pouvant porter des entailles
Corps profilé, gris foncé avec le ventre blanc
Nageoires étroites, pointues et foncées avec les rebord et le dessous blanc
Ne montre habituellement  pas la queue, petite relativement à la taille du corps, dessus foncé, dessous blanc 
Ne soulève généralement pas de la queue en plongeant
Alimentation :  bancs de petits poissons, krill
Plonge : 4-12 minutes
Baleineaux naissent :  décembre à mars
Sevrage :1 an
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Rorqual boréal (Balaenoptera borealis)
Longueur : 12-18 m
Caractéristiques : 
Jet bas et droit
Tête étroite et pointu
Grand, nageoire dorsale triangulaire
Corps profilé ; gris foncé avec des cicatrices circulaires
Nageoires étroites, pointues et foncées
Ne montre habituellement  pas la queue, de petite taille relativement au corps, foncée sur les deux côtés
Ne soulève généralement pas de la queue en plongeant
Alimentation :  zooplanctons, bancs de petits poissons, krill
Plonge : 10 minutes
Baleineaux naissent :  décembre à mars
Sevrage : 1 an
Occurrence : Baie de Fundy : occasionnel

Petit rorqual (Balaenoptera acutorostrata)
Longueur : 3,7-9 m
Caractéristiques : 
Jet habituellement non visible
Étroit, tête très pointue
Nageoire dorsale falciforme ou en crochet
Corps profilé
Nageoires étroites, pointues et foncées des bandes blanches sur le dessus
Ne montre habituellement pas la queue, petite, dessus foncé et dessous blanc
Ne soulève généralement pas de la queue en plongeant
Alimentation :  bancs de petits poissons, krill
Plonge : 5-30 minutes
Baleineaux naissent :  décembre à mars
Sevrage : 6 mois
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Baleine á bosse (Megaptera novaeangliae)
Longueur : 12-18 m
Caractéristiques : 
Jet en forme de ballon
Tête étroite avec des bosses (tubercules) sur le dessus de la tête et sur le menton
Nageoire dorsale, bosse sous la nageoire
Corps large et trapu; foncé avec le ventre généralement blanc
Longues nageoires bosselées, habituellement blanches
Queue à rebord dentelé, foncée sur le dessus et de couleur variable en dessous, barnacles souvent présentes sur les extrémités
La queue n’est pas soulevée à la verticale lorsque la baleine plonge
Alimentation :  bancs de petits poissons, krill
Plonge : 4-15 minutes
Baleineaux naissent :  décembre à mars, carribe
Sevrage : 1 an
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Dauphin à flancs blancs de l'Atantique (Lagenorhynchus acutus)
Longueur : 1,9-2,8 m
Caractéristiques : 
Nageoire dorsale grande et en forme de faucille 
Bec distinct 
Taches jaunes et blanches le long des côtés, dessus foncé et dessous blanc 
Actifs à la surface, saut clair, se promène en boucles 
Habituellement en grands groupes de 10 à 500 individus
Alimentation :  bancs de petits poissons, calmar, krill
Plonge : 3-5 minutes
Baleineaux naissent : 
Sevrage : 1 an
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Marsouin commun (Phocoena phocoena)
Longueur : 1-1,8 m
Caractéristiques : 
Nageoire dorsale petite et trianguliare
Aucun bec distinct 
Corps robuste, haut et gris foncé avec le dessous blanc
Fait généralement surface rapidement, évite les navires, saute rarement, se repose parfois à la surface lors des  jours calmes
Normalement en petits groupes
Alimentation :  bancs de petits poissons, calmar, krill
Plonge : 1-5 minutes
Baleineaux naissent :  mai à juin
Sevrage: 6 mois
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Phoque commun (Phoca vitulina vitulina)
Longueur : 1-1,8 m 
Caractéristiques : 
Forme du corps ressemblant à celui d’un épagneul de cocker.
Pelage chiné d’un brun pâle au brun foncé. 
Sort sa tête de l’eau pour respirer. 
se repose sur des rochers côtiers à marée basse. 
Alimentation : poissons, calmars, crustacés et d’invertébrés
Petits naissent :  mai à juin
Sevrage: ~1 mois
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Phoque gris (Halichoerus grypus)
Longueur : 2-2,4m 
Caractéristiques : 
Longue tête de « forme romaine »,  également surnommée "tête de cheval". 
Mâle plus grand que la femelle. 
Mâle foncé avec des taches pâles; femelle pâle avec des taches foncées. 
Ressort à la surface de l’eau pour prendre son souffle. 
Se repose sur les rivages rocheux à marée basse. 
Alimentation : poissons, calmars, crustacés et d’invertébrés.
Petits naissent :  janvier à mars
Sevrage: ~1 mois
Occurrence : Baie de Fundy : Commun

Références:

"A field guide to whales, porpoises and seals from Cape Cod to Newfoundland". 4th ed. Steve Katona, Valerie Rough & David Richardson. 1993. Smithsonian Press. 316pp

"Marine Mammals of the Bay of Fundy with a reference summary of the conservation & protection status of marine mammals in all Canadian waters". David Gaskin. 1997. Bulletin No. 1, Whale & Seabird Research Station. 121pp.

"A History of the Mammals of Grand Manan" in "The Other Creatures", L.K. Ingersoll & S.W. Gorham. 1978. The Grand Manan Historian, No. XX, pp. 31-54.

"Whales of the Bay of Fundy". Tim Beatty. 1989. Sunbury Shores. 50pp